Подход к обработке многомерных данных пептидных микрочипов
Аннотация
Рассматривается подход к обработке многомерных данных пептидных микрочипов. Основными этапами используемой технологии являются предобработка с целью уменьшения аппаратных ошибок измерений, снижения размерности для выделения переменных, наилучшим образом описывающих исходные данные, и классификация тестовых данных, результатом которой является определение класса нового объекта, с использованием множества объектов-образцов. Ввиду малого количества тестовых данных (в работе использовались пробы 25 доноров, из которых 15 — условно здоровые и 10 — с диагнозом рака молочной железы) работа нацелена на апробацию различных алгоритмов обработки, анализ применимости и выявление путей их дальнейшего развития с целью улучшения качества и повышения устойчивости результатов при применении этих алгоритмов. Результатом работы является технология обработки данных пептидных микрочипов, и при дальнейшей доработке возможно ее применение на реальных данных с использованием большего количества образцов и большего количества классов.
DOI 10.14258/izvasu(2015)1.2-13
Скачивания
Metrics
Литература
Stafford P., Cichacz Z., Woodbury N., Johnston S.A. Immunosignature System for Diagnosis of Cancer // PNAS. - 2014. DOI:10.1073/pnas.1409432111.
Форматы файлов GenePix (GenePix® File Formats) [Электронный ресурс]. - URL: http://mdc.custhelp.com/ app/answers/detail/a_id/18883/~/genepix%C2 %AE-file-formats.
Sykes K., Legutki J.B., Stratford P. Immunosignaturing: a critical review // Cell Press. - 2012. DOI:10.1016/j.tibtech.2012.10.012.
Cretich M., Chiari M. Peptide Mycroarrays. Methods and Protocols // Humana Press. - 2009. D0I:10.1007/978-1-60327-394-7.
Максимов А.В., Оскорбин Н.М. Многопользовательские информационные системы: основы теории и методы исследования. - Барнаул, 2013.
Оскорбин Н. М. Математические модели систем с латентными переменными // Известия Алт. гос. ун-та. - 2012. - № 1/2 (73).
